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小麥源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則發(fā)表時間:2021-03-05 16:03 小麥源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則: 1, 先選擇好探針,然后設(shè)計引物使其盡可能的靠近于探針。 2, 擴(kuò)增子的長度應(yīng)不超過400bp,理想的*能在100-150bp內(nèi),擴(kuò)增片斷約短,有效的擴(kuò)增反應(yīng)就越容易獲得。較短的擴(kuò)增片斷也容易保證分析的一致性 3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區(qū)容易產(chǎn)生非特異反應(yīng),從而會導(dǎo)致擴(kuò)增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。 4, 為了保證效率和重復(fù)性,應(yīng)避免重復(fù)的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個連續(xù)的G) 5, 將引物和探針互相進(jìn)行配對檢測,以避免二聚體和發(fā)卡結(jié)構(gòu)的形成。 b),探針設(shè)計指導(dǎo) 1,在設(shè)計引物之前設(shè)計探針 2,探針的Tm值應(yīng)在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細(xì)審查GC富含區(qū)。 3,探針的5’端要避免有鳥氨酸,5’G會有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在 4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會降低反應(yīng)效率,這時就應(yīng)選擇配對的另一條鏈作為探針。 6, 探針應(yīng)盡可能的短,不要超過30個bp。 7, 檢測探針的DNA折疊和二級結(jié)構(gòu)。 PCR實驗步驟 典型的PCR由(1)高溫變性模板;(2)引物與模板退火;(3)引物沿模板延伸三步反應(yīng)組成一個循環(huán),通過多次循環(huán)反應(yīng),使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。其主要步驟是: 將待擴(kuò)增的模板DNA置高溫下(通常為93℃-94℃)使其變性解成單鏈; ??人工合成的兩個寡核苷酸引物在其合適的復(fù)性溫度下分別與目的基因兩側(cè)的兩條單鏈互補(bǔ)結(jié)合,兩個引物在模板上結(jié)合的位置決定了擴(kuò)增片段的長短; ??耐熱的DNA聚合酶(Taq酶)在72℃將單核苷酸從引物的3’端開始摻入,以目的基因為模板從5’→3’方向延伸,合成DNA的新互補(bǔ)鏈。 |
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