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細(xì)菌送樣有哪些要求?發(fā)表時(shí)間:2020-05-15 13:12 隨著高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)的快速發(fā)展,細(xì)菌全基因組de novo測(cè)序已然成為一種探究細(xì)菌生物學(xué)問題的高性價(jià)比方法。通過全基因組測(cè)序,可以獲知待測(cè)菌株的基因及相關(guān)調(diào)控信息,為研究該菌株特有的生物學(xué)特征(致病機(jī)制,共生機(jī)制,獨(dú)有的代謝機(jī)制)提供分子生物學(xué)基礎(chǔ);通過比較基因組分析,為研究菌株種內(nèi)及種間的功能差異、進(jìn)化關(guān)系提供理論指導(dǎo)。 樣品類型:菌體 送樣要求:菌體不宜培養(yǎng)時(shí)間過長,以對(duì)數(shù)生長中期細(xì)胞**; 樣品量:掃描圖≥3O D·mL的菌液對(duì)應(yīng)的菌體沉淀,完成圖≥50O D·mL的菌液對(duì)應(yīng)的菌體沉淀;D·mL=OD600的值*菌液體積 將裝有菌體沉淀的離心管在干冰/冰袋條件下寄送,或是暫時(shí)存放于-80℃后再干冰/冰袋寄送。另送1-2份樣品備份; 樣品類型:DNA 送樣要求樣品量:掃描圖DNA總量≥1μg,濃度≥20ng/μL,完成圖DNA總量≥1μg,濃度≥20ng/μL; DNA質(zhì)量:OD260/280=1.8-2.0,OD260/230=1.8-2.2;DNA的主峰帶明顯且在2kb以上,無明顯RNA污染; 為了避免DNA樣品的降解,寄送過程中務(wù)必保證足夠的干冰/冰袋,避免樣品反復(fù)凍融,送樣時(shí)注明溶劑組分; 注:老師在拿到DNA膠圖后,如不確定樣品是否合格,可在送樣之前先將膠圖發(fā)送到mdna@majorbio.com,由技術(shù)人員評(píng)估確認(rèn)后再進(jìn)行樣品寄送;病原微生物只接受DNA樣本。 |
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